Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ankrd34aB2RW11 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms