Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Abcc8B2RUS7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms