Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phf3B2RQG2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phf3B2RQG2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms