Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm436B1AVU6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms