Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NhsB1AV60 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NhsB1AV60 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NhsB1AV60 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NhsB1AV60 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NhsB1AV60 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NhsB1AV60 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NhsB1AV60 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NhsB1AV60 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NhsB1AV60 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NhsB1AV60 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms