Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pramef20B1ARV6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramef20B1ARV6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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