Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm5640A3KG49 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm5640A3KG49 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm5640A3KG49 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm5640A3KG49 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm5640A3KG49 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm5640A3KG49 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm5640A3KG49 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm5640A3KG49 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm5640A3KG49 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm5640A3KG49 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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