Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Samt1A2BED8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Samt1A2BED8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Samt1A2BED8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Samt1A2BED8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Samt1A2BED8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Samt1A2BED8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Samt1A2BED8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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