Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb1A2AQ07 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb1A2AQ07 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms