Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GabreA2AMW3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GabreA2AMW3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms