Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Trav12-2A0N8N6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Trav12-2A0N8N6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trav12-2A0N8N6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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