Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms