Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3b1Q9Z1T1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms