Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lgr5Q9Z1P4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms