Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec2Q9WV35 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apobec2Q9WV35 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms