Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scnn1bQ9WU38 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms