Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms