Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col4a3Q9QZS0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms