Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Cbx8Q9QXV1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cbx8Q9QXV1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms