Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lsm4Q9QXA5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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