Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rabgef1Q9JM13 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rabgef1Q9JM13 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rabgef1Q9JM13 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms