Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms