Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms