Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms