Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cse1lQ9ERK4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cse1lQ9ERK4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms