Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syde1Q9DBZ9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syde1Q9DBZ9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms