Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gm2541-201ENSMUST00000161209 711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Asb11-202ENSMUST00000036858 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riok3Q9DBU3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms