Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc89Q9DA73 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms