Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms