Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9D8N1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms