Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms