Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sdr42e1Q9D665 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms