Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms