Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc81Q9D5W4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms