Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc105Q9D4K7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms