Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Krt20Q9D312 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Krt20Q9D312 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Krt20Q9D312 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt20Q9D312 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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