Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddx56Q9D0R4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddx56Q9D0R4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddx56Q9D0R4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms