Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG3

Commd8, COMM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd8Q9CZG3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Commd8Q9CZG3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Commd8Q9CZG3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms