Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Xrcc3Q9CXE6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms