Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cdca4Q9CWM2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms