Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms