Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmed6Q9CQG0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmed6Q9CQG0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms