Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rnaseh2cQ9CQ18 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnaseh2cQ9CQ18 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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