Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2a1Q99PM3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2a1Q99PM3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms