Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

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Length 3,354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cdh23Q99PF4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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