Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NsmfQ99NF2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NsmfQ99NF2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms