Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atoh8Q99NA2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atoh8Q99NA2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms