Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrrtQ99MR6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrrtQ99MR6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms