Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp1b4Q99ME6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp1b4Q99ME6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms