Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf2Q99LE6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms